Список наших публикаций по метагеному

Shashkova, T., Popenko, A., Tyakht, A., Peskov, K., Kosinsky, Y., Bogolubsky, L., ... & Govorun, V. (2016). Agent Based Modeling of Human Gut Microbiome Interactions and Perturbations. PLOS ONE, 11(2), e0148386.
 
Dubinkina, V. B., Ischenko, D. S., Ulyantsev, V. I., Tyakht, A. V., & Alexeev, D. G. (2016). Assessment of k-mer spectrum applicability for metagenomic dissimilarity analysis. BMC bioinformatics, 17(1), 1.
 
Alexeev D, Bibikova T, Kovarsky B, Melnikov D, Tyakht A, Govorun V. Bacterial rose garden for metagenomic SNP-based phylogeny visualization. BioData Min. 2015 Mar 21;8:10. doi: 10.1186/s13040-015-0045-5. eCollection 2015. 
 
Огородова, Л. М., Говорун, В. М., Федосенко, С. В., Карнаушкина, М. А., Салтыкова, И. В., Алексеев, Д. Г., ... & Попенко, А. С. (2014). Особенности микробиоты кишечника у больных хронической обструктивной болезнью легких. Бюллетень сибирской медицины, 13(5), 55-61.
 
Федосенко, С. В., Огородова, Л. М., Карнаушкина, М. А., Куликов, Е. С., Деев, И. А., & Кириллова, Н. А. (2014). Роль сообщества микроорганизмов дыхательных путей в патогенезе хронической обструктивной болезни легких. Бюллетень сибирской медицины, 13(1), 153-160. 
 
Кострюкова, Е. С., Карпова, И. Ю., Ларин, А. К., Попенко, А. С., Тяхт, А. В., & Ильина, Е. Н. (2014). Вариабельность относительного содержания геномной ДНК человека при метагеномном анализе микробиоты кишечника. Биомедицинская химия, 60(6), 695-701.

Tyakht AV, Alexeev DG, Popenko AS, Kostryukova ES, Govorun VM. Rural and urban microbiota: To be or not to be? Gut Microbes. 2014 May-Jun;5(3):351-6. doi:10.4161/gmic.28685. Epub 2014 Apr 1. 

Tyakht AV, Kostryukova ES, Popenko AS, Belenikin MS, Pavlenko AV, Larin AK, Karpova IY, Selezneva OV, Semashko TA, Ospanova EA, Babenko VV, Maev IV, Cheremushkin SV, Kucheryavyy YA, Shcherbakov PL, Grinevich VB, Efimov OI, Sas EI, Abdulkhakov RA, Abdulkhakov SR, Lyalyukova EA, Livzan MA, Vlassov VV, Sagdeev RZ, Tsukanov VV, Osipenko MF, Kozlova IV, Tkachev AV, Sergienko VI, Alexeev DG, Govorun VM. Human gut microbiota community structures in urban and rural populations in Russia. Nat Commun.2013;4:2469. doi: 10.1038/ncomms3469

Tyakht AV, Popenko AS, Belenikin MS, Altukhov IA, Pavlenko AV, Kostryukova ES, Selezneva OV, Larin AK, Karpova IY, Alexeev DG. MALINA: a web service for visual analytics of human gut microbiota whole-genome
metagenomic reads. Source Code Biol Med. 2012 Dec 7;7(1):13. doi: 10.1186/1751-0473-7-13